Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-DMaP28078 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms