Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xrcc5P27641 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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