Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd1P25322 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms