Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd12P23812 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd12P23812 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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