Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo5bP21271 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo5bP21271 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms