Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ntf3P20181 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ntf3P20181 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms