Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PdgfaP20033 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PdgfaP20033 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms