Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD53P19397 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD53P19397 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD53P19397 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD53P19397 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD53P19397 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD53P19397 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD53P19397 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD53P19397 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD53P19397 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD53P19397 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD53P19397 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD53P19397 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD53P19397 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD53P19397 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD53P19397 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD53P19397 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD53P19397 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD53P19397 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD53P19397 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD53P19397 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD53P19397 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD53P19397 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD53P19397 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD53P19397 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD53P19397 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD53P19397 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD53P19397 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD53P19397 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD53P19397 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD53P19397 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD53P19397 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD53P19397 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD53P19397 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD53P19397 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD53P19397 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD53P19397 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD53P19397 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD53P19397 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD53P19397 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD53P19397 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CD53P19397 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD53P19397 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD53P19397 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD53P19397 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD53P19397 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD53P19397 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD53P19397 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD53P19397 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD53P19397 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD53P19397 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD53P19397 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD53P19397 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD53P19397 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD53P19397 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD53P19397 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CD53P19397 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD53P19397 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD53P19397 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD53P19397 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD53P19397 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD53P19397 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD53P19397 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD53P19397 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD53P19397 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD53P19397 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD53P19397 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD53P19397 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD53P19397 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD53P19397 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD53P19397 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD53P19397 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD53P19397 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD53P19397 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD53P19397 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD53P19397 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD53P19397 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD53P19397 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD53P19397 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CD53P19397 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD53P19397 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms