Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc1P18828 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdc1P18828 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms