Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpraP18052 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpraP18052 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpraP18052 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpraP18052 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpraP18052 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpraP18052 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpraP18052 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpraP18052 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpraP18052 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpraP18052 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms