Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb1P17919 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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