Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms