Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Dnmt1P13864 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms