Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nr4a1P12813 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms