Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms