Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TtrP07309 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TtrP07309 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtrP07309 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtrP07309 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TtrP07309 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtrP07309 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtrP07309 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TtrP07309 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TtrP07309 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TtrP07309 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TtrP07309 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TtrP07309 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TtrP07309 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TtrP07309 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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TtrP07309 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TtrP07309 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TtrP07309 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TtrP07309 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TtrP07309 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtrP07309 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtrP07309 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtrP07309 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtrP07309 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtrP07309 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TtrP07309 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtrP07309 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtrP07309 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtrP07309 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtrP07309 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtrP07309 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtrP07309 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtrP07309 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtrP07309 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtrP07309 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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