Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ItgamP05555 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgamP05555 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgamP05555 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgamP05555 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgamP05555 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms