Protein–RNA interactions for Protein: P01674

Ig kappa chain V-III region PC 2154, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01674 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01674 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01674 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01674 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01674 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01674 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01674 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01674 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01674 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01674 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01674 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01674 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01674 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01674 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01674 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01674 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01674 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01674 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01674 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01674 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01674 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01674 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01674 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01674 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01674 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01674 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01674 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01674 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01674 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01674 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01674 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01674 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01674 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01674 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01674 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01674 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01674 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01674 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01674 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01674 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01674 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01674 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01674 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01674 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms