Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01629 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01629 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
P01629 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01629 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01629 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01629 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01629 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01629 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01629 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01629 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
P01629 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01629 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01629 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01629 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01629 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01629 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01629 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01629 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01629 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01629 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01629 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01629 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01629 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01629 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01629 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01629 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01629 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01629 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01629 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01629 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01629 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01629 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01629 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01629 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01629 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01629 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01629 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01629 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01629 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01629 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01629 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01629 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01629 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01629 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01629 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01629 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01629 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01629 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01629 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01629 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01629 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01629 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01629 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01629 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01629 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01629 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01629 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01629 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01629 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01629 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01629 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01629 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01629 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01629 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01629 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01629 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01629 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01629 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
P01629 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01629 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01629 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01629 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01629 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01629 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01629 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01629 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01629 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01629 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01629 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01629 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01629 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms