Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifnb1P01575 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifnb1P01575 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms