Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna1P01572 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna1P01572 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms