Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abl1P00520 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Abl1P00520 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Abl1P00520 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abl1P00520 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abl1P00520 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abl1P00520 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abl1P00520 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abl1P00520 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abl1P00520 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abl1P00520 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Abl1P00520 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms