Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sypl2O89104 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sypl2O89104 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms