Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcn3O88705 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn3O88705 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms