Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BlmO88700 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BlmO88700 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BlmO88700 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
BlmO88700 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BlmO88700 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BlmO88700 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BlmO88700 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BlmO88700 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BlmO88700 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BlmO88700 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BlmO88700 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BlmO88700 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BlmO88700 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BlmO88700 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BlmO88700 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BlmO88700 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BlmO88700 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
BlmO88700 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BlmO88700 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BlmO88700 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BlmO88700 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BlmO88700 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BlmO88700 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BlmO88700 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BlmO88700 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BlmO88700 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BlmO88700 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BlmO88700 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BlmO88700 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BlmO88700 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
BlmO88700 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BlmO88700 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BlmO88700 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BlmO88700 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BlmO88700 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BlmO88700 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BlmO88700 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BlmO88700 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BlmO88700 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BlmO88700 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BlmO88700 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BlmO88700 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BlmO88700 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BlmO88700 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BlmO88700 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BlmO88700 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BlmO88700 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BlmO88700 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BlmO88700 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BlmO88700 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
BlmO88700 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
BlmO88700 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
BlmO88700 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BlmO88700 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BlmO88700 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BlmO88700 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BlmO88700 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BlmO88700 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BlmO88700 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BlmO88700 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BlmO88700 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BlmO88700 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BlmO88700 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BlmO88700 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BlmO88700 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BlmO88700 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BlmO88700 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BlmO88700 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BlmO88700 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BlmO88700 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BlmO88700 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BlmO88700 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BlmO88700 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BlmO88700 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
BlmO88700 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BlmO88700 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BlmO88700 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BlmO88700 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BlmO88700 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BlmO88700 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BlmO88700 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BlmO88700 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
BlmO88700 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BlmO88700 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BlmO88700 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BlmO88700 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BlmO88700 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BlmO88700 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BlmO88700 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BlmO88700 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BlmO88700 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BlmO88700 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BlmO88700 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BlmO88700 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BlmO88700 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BlmO88700 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BlmO88700 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BlmO88700 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BlmO88700 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms