Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CntfrO88507 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntfrO88507 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntfrO88507 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CntfrO88507 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntfrO88507 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CntfrO88507 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CntfrO88507 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms