Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfi1bO70237 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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