Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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