Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms