Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfrsf18O35714 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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Tnfrsf18O35714 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfrsf18O35714 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf18O35714 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf18O35714 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf18O35714 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf18O35714 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf18O35714 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf18O35714 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf18O35714 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf18O35714 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf18O35714 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf18O35714 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf18O35714 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf18O35714 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfrsf18O35714 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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