Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb3O35393 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb3O35393 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb3O35393 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb3O35393 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Efnb3O35393 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb3O35393 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb3O35393 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb3O35393 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb3O35393 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb3O35393 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb3O35393 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb3O35393 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efnb3O35393 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb3O35393 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb3O35393 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb3O35393 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb3O35393 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb3O35393 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Efnb3O35393 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb3O35393 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb3O35393 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb3O35393 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb3O35393 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb3O35393 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb3O35393 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb3O35393 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb3O35393 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efnb3O35393 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb3O35393 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb3O35393 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb3O35393 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb3O35393 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb3O35393 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb3O35393 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb3O35393 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb3O35393 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb3O35393 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb3O35393 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb3O35393 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb3O35393 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efnb3O35393 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efnb3O35393 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efnb3O35393 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Efnb3O35393 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb3O35393 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Efnb3O35393 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb3O35393 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb3O35393 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb3O35393 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb3O35393 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb3O35393 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb3O35393 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Efnb3O35393 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb3O35393 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb3O35393 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Efnb3O35393 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb3O35393 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb3O35393 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Efnb3O35393 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Efnb3O35393 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Efnb3O35393 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms