Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f3O35261 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f3O35261 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f3O35261 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f3O35261 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f3O35261 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f3O35261 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2f3O35261 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2f3O35261 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2f3O35261 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2f3O35261 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2f3O35261 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms