Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pitx3O35160 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pitx3O35160 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms