Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnih2O35089 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih2O35089 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih2O35089 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih2O35089 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih2O35089 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih2O35089 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih2O35089 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnih2O35089 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih2O35089 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih2O35089 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih2O35089 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih2O35089 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih2O35089 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms