Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcof1O08784 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcof1O08784 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms