Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nfil3O08750 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nfil3O08750 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms