Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm19965J3QNY8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm19965J3QNY8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm19965J3QNY8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm19965J3QNY8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Gm19965J3QNY8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Gm19965J3QNY8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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Gm19965J3QNY8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Gm19965J3QNY8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Gm19965J3QNY8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Gm19965J3QNY8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Gm19965J3QNY8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Gm19965J3QNY8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Gm19965J3QNY8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Gm19965J3QNY8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Gm19965J3QNY8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm19965J3QNY8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm19965J3QNY8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm19965J3QNY8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm19965J3QNY8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm19965J3QNY8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm19965J3QNY8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm19965J3QNY8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm19965J3QNY8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm19965J3QNY8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm19965J3QNY8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm19965J3QNY8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm19965J3QNY8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm19965J3QNY8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm19965J3QNY8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm19965J3QNY8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms