Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms