Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34c2J3QNM1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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