Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20696H3BJN7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20696H3BJN7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms