Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubap1lG3UW59 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ubap1lG3UW59 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubap1lG3UW59 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubap1lG3UW59 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubap1lG3UW59 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubap1lG3UW59 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubap1lG3UW59 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms