Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col22a1E9Q7P1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col22a1E9Q7P1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms