Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BC005561E9Q5E2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
BC005561E9Q5E2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms