Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
8030474K03RikE9Q4Y8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
8030474K03RikE9Q4Y8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
8030474K03RikE9Q4Y8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
8030474K03RikE9Q4Y8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
8030474K03RikE9Q4Y8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
8030474K03RikE9Q4Y8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
8030474K03RikE9Q4Y8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
8030474K03RikE9Q4Y8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
8030474K03RikE9Q4Y8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
8030474K03RikE9Q4Y8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
8030474K03RikE9Q4Y8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
8030474K03RikE9Q4Y8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms