Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930579F01RikE9Q3L6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930579F01RikE9Q3L6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms