Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Abcc4E9Q236 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcc4E9Q236 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms