Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0M3

Gm9268, Predicted gene 9268, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9268E9Q0M3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm9268E9Q0M3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm9268E9Q0M3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms