Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt78E9Q0F0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt78E9Q0F0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms