Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx6-2D3Z4R4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx6-2D3Z4R4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms