Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syce3B5KM66 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syce3B5KM66 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce3B5KM66 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms